Микробиом. То, что убивает, и то, что делает нас сильнее - Игорь Олегович Стома

меньшей стабильностью при их исследовании, и, возможно, что их просто не полностью выявляют. Есть и другой цифровой пример: в морской воде в норме содержится около 107 вирусных частиц на миллилитр, а в человеческих фекалиях 109 вирусных частиц на грамм. Логично, что изменения в составе вирусов в кишечнике связаны с изменениями в составе бактерий, то есть это сложная межвидовая биологическая система. Возможно, что и процесс мутации вирусов происходит в основном в кишечнике, где высочайшая концентрация этих элементов. По сути, кишечник – это резервуар для вирусов. Как и место работы для иммунной системы. Ведь, как известно, 80 % от всех клеток иммунной системы человека находится именно в кишечнике. Ярким примером резервуара вируса в кишечнике является ВИЧ.

Почему, несмотря на новые и очень эффективные комбинации препаратов, излечить ВИЧ в мире пока не удалось? Дело как раз в резервуаре вируса в части клеток. Часть вируса остается интегрированным в геном иммунных клеток человека, не размножается на фоне лечения противовирусными препаратами, но и не уничтожается. И при отмене лечения возобновляет свою активность. Поэтому люди, живущие с ВИЧ, и проходят антиретровирусную терапию пожизненно. И как раз кишечник, как место скопления иммунных клеток, в которые интегрирован вирус, и является одним из значимых резервуаров ВИЧ. Сегодня в мире разрабатываются стратегии победы над этими резервуарами вируса, ведь только тогда получится заявить о полном излечении от болезни. Два основных направления включают схемы Shock and Kill и Block and Lock. В первом случае с помощью специальным молекул активируют спящие клетки со спрятанным в них вирусом ВИЧ и затем усиленной схемой противовирусных препаратов вместе с помощью от иммунных клеток пытаются уничтожить инфицированные клетки. Второй вариант предполагает блокировать и снижать активность инфицированных клеток в резервуаре с помощью целевых лекарств. При достаточно длительном блокировании у любой клетки заканчивается ее жизненный цикл, и она погибает, не успев передать вирус новой клетке. Далее все погибшие инфицированные клетки из резервуара удаляются из организма.

Сегодня изменения вирома человека, как по составу вирусов, так и по их разнообразию, изучены при ряде болезней. Выявлены изменения в вироме при воспалительных заболеваниях кишечника, при сахарном диабете, артериальной гипертензии, колоректальном раке. Немаловажно и то, что изменения в бактериальном микробиоме, при бактериальном вагинозе, например, ассоциированы с изменениями и в вирусной части, то есть в вироме соответствующей локализации. Вернемся в прошлое, во времена эпидемии гриппа «испанки» 1918–1920 годов. Она, как известно, была вызвана вирусом, но погибали люди в основном, от вторичных бактериальных осложнений, от бактериальных пневмоний, вызванные пневмококком. Страшно представить эти цифры, но за 18 месяцев этой пандемии в мире погибло около 50 миллионов человек, что больше, чем количество жертв Первой мировой войны. А ведь врачи давно знают, вирусы часто «открывают окно» для входа вторичных бактериальных осложнений. Почему после простых вирусных инфекций часто возникают гнойные отиты, синуситы, пневмонии? Вирусы повреждают защитные механизмы слизистых оболочек, «срывают» покров местного иммунитета и освобождают пространство для бактерий. Вот почему так нередки вторые волны повышения температуры после банальных ОРВИ – это, вполне возможно, присоединился бактериальный процесс. Кстати, ученые обнаружили, что вакцинация от вирусной инфекции, например от гриппа, на уровне общества снижает и количество бактериальных пневмоний в осенне-зимний сезон, а также гнойных синуситов. Вот такое весьма известное сотрудничество вирусов и бактерий в природе!

Рис. 44. Стратегии борьбы с резервуарами ВИЧ в организме с целью полного излечения. Адаптировано из Matsuda K, Maeda K. HIV Reservoirs and Treatment Strategies toward Curing HIV Infection. International Journal of Molecular Sciences. 2024; 25(5):2621.

Вполне возможно, что биологическая роль вирусов для человека заключается в постоянной стимуляции иммунной системы, поддержании ее боеготовности в случае внешней атаки более опасных, вирулентных вирусов. Поэтому виром, как хороший инструктор тренажерного зала, постоянно развивает и укрепляет «мышцы» нашего иммунитета. В связи с этим вспомним, что часть вирусов способны запускать онкологические процессы (вирус гепатита В, вирусы папилломы человека), поэтому собственный виром человека, как предполагается, еще и способен конкурировать с внешними «захватчиками» из числа более опасных вирусов.

Кстати, изучение бактериофагов как вирусов, нацеленных на бактерии, сегодня в мировой науке переживает свое второе рождение. Ранее, во второй половине XX века этим направление занималось всего несколько научных школ в мире, а ведущие специалисты и крупнейшие коллекции бактериофагов были в лабораториях СССР. А ведущая школа изучения бактериофагов в стране была в Тбилисском институте микробиологии, эпидемиологии и бактериофагов. Уже тогда создавались фаговые смеси для лечения ряда бактериальных инфекций. При этом помнится, что это направление было весьма мало развито у западных научных школ, а нередко и критиковалось на международных научных мероприятиях. Но эта критика осталась позади, и сегодня в европейских и американских лабораториях немало сил тратится на разработку новых «коктейлей фагов» для лечения бактериальных инфекций. Почему, вы спросите? Да потому, что за последний десяток лет настолько выросла устойчивость бактерий к антибиотикам, что лечить некоторые внутрибольничные инфекции антибиотиками уже не получается. И грамотно подобранный «коктейль из фагов» может стать единственным методом спасения для пациента с тяжелым сепсисом (заражением крови), вызванным устойчивой к антибиотикам бактерией. Сложностью массового внедрения лечебных фагов пока что остается некоторая индивидуальность их подбора под конкретную инфекцию, вызванную конкретным видом микроба. По сути, это является индивидуализированной терапией, методом спасения конкретного тяжелого пациента. Ну и время создания нужного «коктейля фагов» тоже не всегда самое быстрое. Но мы уверены, что в этом направлении еще ожидается немало успехов и внедрений в практику медицины.

В связи с дальнейшим внедрением молекулярно-генетических технологий стали пересматриваться, казалось бы, прочные медицинские теории. Например, много лет в медицине считалось, что в крови как в «стерильной» жидкости в норме не может находиться не то что бактерий, но и даже вирусов. А сегодня мы знаем, что в крови у многих здоровых людей находятся вирусы. Термин «виром крови» уже стал проникать из науки в практическую деятельность.

Один из распространенных в крови вирусов – вирус TTV (Torque Teno Virus). Этот вирус обнаруживается в крови у многих абсолютно здоровых людей (68–80 %), но в малых количествах. Не так давно количество его в крови было предложено оценивать как измерительный показатель функции иммунной системы у пациентов после пересадки органов и тканей. В случае подавления иммунитета от любой причины этот вирус начинает более активно размножаться в крови, а его количество преодолевает определенные пороги. Поэтому у пациентов, получающих препараты против отторжения органов, действующих путем подавления иммунной системы, именно с помощью оценки уровня TTV в вироме крови можно понять, как